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檢測禽流感病毒的方法

來源:愛儀器儀表網(wǎng)  發(fā)布時間:17-03-02 13:56  作者:ai1718  瀏覽次數(shù):526  分類:技術文章

2013年3月份,“H7N9”在上海和安徽率先發(fā)現(xiàn),隨后在江蘇,浙江傳播蔓延。生物學家已經(jīng)檢測出這種病毒的結(jié)構確認其毒株了。北京熙縝隆博環(huán)保科技有限公司代理的儀器會成為您的*,歡迎有意購買者撥打公司熱線電話010-68940148。

H7N9

一、單鏈構型多態(tài)性(SSCP)

作為檢測基因變異的手段已得到廣泛應用,其原理是單個核苷酸的置換引起DNA單鏈構象改變,在非變性電泳中足以導致泳動率變化。


二、血清學檢測

2.1病毒中和試驗(NT) 作為經(jīng)典方法,病毒中和實驗操作繁瑣、耗時、費料,臨床幾乎不用。

2.2血凝(HA)和血凝抑制(HI)試驗AIV 能夠與雞紅細胞發(fā)生凝集現(xiàn)象,這種紅細胞凝集現(xiàn)象又可被特異性免疫血清所抑制,即紅細胞凝集抑制試驗。血凝和血凝抑制試驗可以鑒定病毒、檢測血清中的抗體水平。用抗不同血凝素的抗血清,由血凝抑制試驗來確定HA亞型。

2.3神經(jīng)氨酸酶抑制(NI)試驗微量神經(jīng)氨酸酶(NA)抑制劑抑制NA的活性,并以半抑制濃度IC50鑒定NA亞型。該方法成本低,適于大規(guī)模地應用。

2.4瓊脂凝膠擴散試驗(AGP) 用于檢測AIV共同抗原核蛋白或基質(zhì)蛋白。由于所有的AIV 都具有型特異性共同抗原,用一種AIV的抗原或抗血清*可對所有AIV 的抗體或抗原進行鑒定。免疫雙向擴散及免疫電泳中以沉淀線判定可以定性,免疫單輻射擴散試驗可以定量。

2.5免疫熒光技術(IFT) 將抗原或抗體標記上熒光素,再進行抗原抗體反應。*早用于流感病毒是鑒定和定位病毒感染細胞中特異性的抗原、核蛋白(NP)或基質(zhì)蛋白(MP)抗原。用NP抗原的熒光抗體染色,主要出現(xiàn)核內(nèi)熒光;用MP抗原的熒光抗體主要出現(xiàn)胞質(zhì)熒光,核內(nèi)也可出現(xiàn)部分熒光。

2.7酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA) 運用ELISA原理建立的AIV檢測方法較多,如用單克隆抗體介導的、經(jīng)生物素一親和素系統(tǒng)放大的H5亞型禽流感病毒捕獲ELISA檢測方法,為進一步研究檢測試劑盒提供基礎。AIV抗體膠體金檢測試紙條則是膠體金免疫層析分析法,用純化病毒與膠體金顆粒偶聯(lián),吸附在玻璃纖維上制作而成,不需要其他試劑,一步完成,反應時間只需要幾分鐘(5~10min),是一種檢測微量AIV抗體快速、簡便的方法。


三、病原學檢測

雞胚分離培養(yǎng)是檢測病禽組織中AIV的一種經(jīng)典、準確、敏感的病原學診斷方法,可以作為金標準,特異性和敏感度均可以達到*。


四、核酸擴增方法

4.1RTPCR基于MP、NP 基因的高度保守區(qū)的引物,RTPCR可以鑒定AIV。為提高擴增的靈敏度和特異性,也可采用巢式或半巢式RTPCR。

4.2多重RTPCR(mRTPCR)mRTRCR是在RTPCR基礎之上實現(xiàn)單管多檢的相對快速和經(jīng)濟的檢測方法。

4.3Realtime RTPCR(RRTPCR)運用特異性的熒光水解探針的RRTPCR方法可使檢測時間縮短為4 h。Lee等建立的檢測H5、H7亞型AIV的RRTPCR方法,與傳統(tǒng)的培養(yǎng)方法比較,并以EID50(50%雞胚致病指數(shù))為評價指標,呈正相關(r  = 0972),T 檢驗無顯著差別(P >021)。其重復性試驗呈正相關(r = 0902),靈敏度H5為1 fg或 102 RNA拷貝,H7為10-1 fg或10 RNA拷貝,所測病毒濃度均低于1010 EID50,該靈敏度高于培養(yǎng)方法。

4.4依賴核酸序列的擴增(NASBA)NASBA是一種快速、等溫的RNA 擴增技術,整個反應有賴于AMV逆轉(zhuǎn)錄酶、T7 RNA 多聚酶和核酸酶H(RNase H)共同協(xié)作而完成,不需特殊儀器,不需溫度循環(huán),是以轉(zhuǎn)錄為基礎,單鏈核苷酸的連續(xù)擴增,其反應產(chǎn)物是單鏈RNA。擴增產(chǎn)物與磁珠上的捕捉探針及釕標記的電化學發(fā)光寡核苷酸探針雜交后,形成復合物,經(jīng)NucliSens閱讀器直接檢測電化學發(fā)光強度。Collins等檢測了亞歐地區(qū)H5亞型AIV,同時還鑒別出高致病及低致病H5亞型。Lau 等建立的NASBA技術可以檢測H1~H15亞型的AIV,并能區(qū)分出H5及H7亞型,整個過程從核酸分離、擴增、檢測在6 h 以內(nèi),靈敏度與雞胚培養(yǎng)相當。

4.5環(huán)介導的等溫擴增(loopmediated isothermal amplification, LAMP)    Poon等介紹了一種新的更加簡便的擴增方法,即環(huán)介導的等溫擴增,特異性地針對6個獨立的結(jié)合位點設計兩對引物擴增,以看家基因或外源性RNA分子作為陽性對照。由于反應中產(chǎn)生大量焦磷酸鎂,可以肉眼判斷結(jié)果,無需凝膠電泳。作者用該方法檢測了SARS病毒后,又檢測了H1~H3的AIV,與常規(guī)方法比較符合率為*。


五、基因芯片

將RTPCR獲得的cDNA固化于芯片,利用核酸探針技術構建的檢測流感病毒A、B及其亞型的芯片平臺, Cy3、Cy5標記的核酸探針與靶DNA雜交,可以進一步鑒別混合體系中擴增產(chǎn)物。Li等用cDNA芯片及mRTPCR對流感病毒進行檢測及分型,結(jié)果顯示cDNA芯片為基于PCR的診斷技術提供了補充,因為基于PCR的方法,直接從DNA擴增片段大小不足以證明是目的產(chǎn)物。


病毒分離培養(yǎng)和血凝抑制試驗經(jīng)常作為評價新的檢測 AIV方法的對照,但病毒分離培養(yǎng)耗時長,至少需7 d,不利于快速診斷,病毒分離的實驗條件要求較高,同時有高致病性的危險,對毒株的檢測及管理上要嚴格考慮生物安全措施。AIV在雞胚培養(yǎng)過程中還可能發(fā)生發(fā)生變異。血凝及血凝抑制試驗特異性好,但其操作相對繁瑣,同時必須具備一定血凝效價的標準病毒和新鮮制備的紅細胞。血清學檢查對*后確診有回顧性診斷價值,一般只能在發(fā)病23周甚至更長時間才能有抗體陽性出現(xiàn)。由于 AIV 血清型眾多,新的變異株不斷出現(xiàn),制備血清型特異性單克隆抗體相對困難,且在各種免疫接種的情況下,血凝抑制試驗等血清學診斷方法也會失去作用。核酸擴增技術(NAT)檢測 AIV,選擇好靶基因和引物及優(yōu)化反應參數(shù),均可獲得高靈敏度和特異性。對于血清型眾多的 AIV,不同亞型致病性不同,宿主分布不同,故快速、特異地分型在 AIV 診斷中顯得尤為重要,而當前的核酸擴增技術尚不能高通量地鑒別出所有 HA 或 NA 的已知亞型。RTPCR 方法能夠獲得所有 AIV 的已知 HA 亞型,但*終結(jié)果尚需借助測序方法,不能作為常規(guī)檢測手段。要實現(xiàn)高通量、大規(guī)模的檢測,有望借助生物芯片這項技術。生物芯片正逐步應用于細菌及病毒的檢測,它不僅能克服 PCR 擴增技術中難題,對 PCR 擴增技術還能起到補充作用。目前人們針對病毒,甚至 AIV 檢測芯片不斷優(yōu)化雜交條件;將核酸擴增產(chǎn)物片段化,以減少核酸二、三級結(jié)構效應對雜交的影響;以及對芯片載體結(jié)構和檢測方法進行改進,都為建立快速、靈敏、特異的 AIV 檢測方法提供平臺。

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